Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3550W4VSN7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms