Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms