Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms