Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms