Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cldn8Q9Z260 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cldn8Q9Z260 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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