Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms