Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip6Q9Z1Y4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms