Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms