Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms