Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setbp1Q9Z180 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Setbp1Q9Z180 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms