Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5Q9Z131 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5Q9Z131 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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