Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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