Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Cldn3Q9Z0G9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cldn3Q9Z0G9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cldn3Q9Z0G9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cldn3Q9Z0G9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cldn3Q9Z0G9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cldn3Q9Z0G9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cldn3Q9Z0G9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cldn3Q9Z0G9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cldn3Q9Z0G9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cldn3Q9Z0G9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cldn3Q9Z0G9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cldn3Q9Z0G9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cldn3Q9Z0G9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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