Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp2Q9Z0E6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms