Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap4s1Q9WVL1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms