Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin2Q9WVE8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms