Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme4Q9WV84 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme4Q9WV84 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme4Q9WV84 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme4Q9WV84 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme4Q9WV84 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme4Q9WV84 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms