Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PplQ9R269 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PplQ9R269 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PplQ9R269 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms