Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms