Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T2

Sae1, SUMO-activating enzyme subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sae1Q9R1T2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sae1Q9R1T2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sae1Q9R1T2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sae1Q9R1T2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sae1Q9R1T2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sae1Q9R1T2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sae1Q9R1T2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sae1Q9R1T2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sae1Q9R1T2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sae1Q9R1T2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sae1Q9R1T2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sae1Q9R1T2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sae1Q9R1T2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sae1Q9R1T2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms