Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms