Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gpc6Q9R087 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gpc6Q9R087 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gpc6Q9R087 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gpc6Q9R087 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gpc6Q9R087 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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