Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkab1Q9R078 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkab1Q9R078 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms