Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmfrQ9R049 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms