Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp11cQ9QZW0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms