Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms