Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col4a4Q9QZR9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Col4a4Q9QZR9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Col4a4Q9QZR9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Col4a4Q9QZR9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Col4a4Q9QZR9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Col4a4Q9QZR9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Col4a4Q9QZR9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms