Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ripk3Q9QZL0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripk3Q9QZL0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms