Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phtf1Q9QZ09 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Phtf1Q9QZ09 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms