Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VapbQ9QY76 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms