Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms