Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nufip1Q9QXX8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms