Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms