Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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