Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SrfQ9JM73 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SrfQ9JM73 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrfQ9JM73 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrfQ9JM73 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrfQ9JM73 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrfQ9JM73 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrfQ9JM73 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SrfQ9JM73 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SrfQ9JM73 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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SrfQ9JM73 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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SrfQ9JM73 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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