Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Higd1aQ9JLR9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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