Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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FancaQ9JL70 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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FancaQ9JL70 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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FancaQ9JL70 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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FancaQ9JL70 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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FancaQ9JL70 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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FancaQ9JL70 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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FancaQ9JL70 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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FancaQ9JL70 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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FancaQ9JL70 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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FancaQ9JL70 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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FancaQ9JL70 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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FancaQ9JL70 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms