Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms