Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms