Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms