Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus3Q9JI38 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms