Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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