Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms