Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn10Q9ESK3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms