Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slco1c1Q9ERB5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms