Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhojQ9ER71 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms