Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms