Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms