Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vmn1r29Q9EQ41 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vmn1r29Q9EQ41 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vmn1r29Q9EQ41 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vmn1r29Q9EQ41 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vmn1r29Q9EQ41 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Vmn1r29Q9EQ41 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vmn1r29Q9EQ41 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Vmn1r29Q9EQ41 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Vmn1r29Q9EQ41 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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