Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms